01 一種檢測(cè)非洲豬瘟病毒(ASFV)的新型靈敏等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的建立
A Arun Prince Milton,Samir Das,Sabia Khan,K M Momin,C B Prasad,H Kylla,Sandeep Ghatak,Arnab Sen
PMID:36740635 DOI:10.1007/s00705-023-05702-z
為在田間或資源受限情況下對(duì)臨床樣本開展檢測(cè),本研究建立了一種快速、簡(jiǎn)便、靈敏的非洲豬瘟病毒(ASFV)核酸檢測(cè)技術(shù)?;谑澜鐒?dòng)物衛(wèi)生組織(WOAH)推薦的p72基因引物,首次采用跨越式滾環(huán)等溫?cái)U(kuò)增(SRCA)技術(shù)檢測(cè)ASFV。檢測(cè)可在58°C等溫條件下于90 min完成,不需復(fù)雜儀器。因SYBR Green熒光染料的存在,可用肉眼判定結(jié)果。該技術(shù)特異性為100%,僅能擴(kuò)增ASFV陽性樣本,而與豬的其他致病性病毒和細(xì)菌無交叉反應(yīng)。SRCA、終點(diǎn)PCR和實(shí)時(shí)熒光PCR的檢測(cè)下限分別為48.4、4.84×103和4.84×103 copies/μL。因此,新建立的SRCA技術(shù)比終點(diǎn)PCR和實(shí)時(shí)熒光PCR靈敏100倍。采用SRCA技術(shù)對(duì)2020—2022年期間從感染ASFV的家豬和其他疑似ASFV感染動(dòng)物采集的臨床樣本進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)準(zhǔn)確率為100%。結(jié)果表明,SRCA是檢測(cè)ASFV的一種簡(jiǎn)單、敏感技術(shù),可提高實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)場(chǎng)診斷能力,尤其是在疫情暴發(fā)期間。由于成本低、特異性強(qiáng)、敏感性好、用戶友好、快速可靠、無需設(shè)備等優(yōu)點(diǎn),這種新型診斷技術(shù)完全符合世界衛(wèi)生組織(WHO)倡導(dǎo)的疾病診斷“ASSURED”標(biāo)準(zhǔn)。因此,SRCA可能比其他復(fù)雜分子技術(shù)更適合ASFV診斷。原文鏈接:?https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36740635/02 分離自印度的牛結(jié)節(jié)性皮膚病 病毒(LSDV)具有獨(dú)特譜系
Lenin Bhatt,Rahul C Bhoyar,Bani Jolly,Ravi Israni,Harie Vignesh,Vinod Scaria,Sridhar Sivasubbu
PMID:36740645 DOI:10.1007/s00705-023-05705-w
牛結(jié)節(jié)性皮膚病病毒(LSDV)以前僅限于在非洲地區(qū)傳播,然而近年來,其已在全世界幾個(gè)區(qū)域引起了規(guī)模疫情。2019年印度報(bào)告了一起LSD疫情,此次疫情發(fā)病率低,未報(bào)告死亡病例。2022年印度7個(gè)邦持續(xù)暴發(fā)LSDV疫情,最終導(dǎo)致3個(gè)月內(nèi)損失8萬多頭牛。在印度拉賈斯坦邦疫情持續(xù)暴發(fā)期間,從感染牛分離了6株LSDV,并對(duì)其完整基因組序列進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,與參考株相比,2022年疫情分離毒株基因組具有大幅遺傳變異,并且形成了獨(dú)特的遺傳譜系。因此,應(yīng)加強(qiáng)基因組測(cè)序和跨界疫病病原體監(jiān)測(cè),以跟蹤變異病原的出現(xiàn)和流行。原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36740645/03 一起養(yǎng)殖鴨不明原因死亡疫情中禽肝病毒和圓環(huán)病毒的鑒定
Dianqi Zhang,Yan Wang,Yumin He,Likai Ji,Kai Zhao,Shixing Yang,Wen Zhang
PMID:36763177 DOI:10.1007/s00705-023-05719-4
病毒宏基因組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于疫病病原體研究。使用該技術(shù),我們查明了導(dǎo)致鴨場(chǎng)大量鴨死亡的潛在病原體。經(jīng)檢測(cè),共鑒定出2株鴨圓環(huán)病毒(DuCV)和1株鴨乙型肝炎病毒(DHBV),二者均與禽類病毒密切相關(guān)。2株DuCV與部分參考毒株全基因序列同源性為81.64%~97.65%,DHBV分離株與其他毒株同源性為75.85%~98.92%。病鴨臨床癥狀包括羽毛皺褶、嗜睡和體重減輕,這與DuCV感染病例類似。DuCV與DHBV合并感染是否導(dǎo)致肝損傷和疾病惡化,還需進(jìn)一步研究。
原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36763177/